地理环境整体性的研究方法是一种基于哲学认识论的方法论,主要围绕着自然课题和社会课题展开。通过具体的自组织理论,如泡散结构理论、协同学、突变论、超循环理论以及分形学和混沌学理论等,可以实现对地球表层空间系统和人地关系地域系统进行复杂性研究。这些方法指导下的研究将有助于深入了解地球表层空间系统与人类社会活动之间的相互作用与影响。