孙殿英以军事演习为名,策划了清东陵盗宝案,盗掘乾隆帝和慈禧太后的陵墓,导致大量珍宝流失。护陵大臣于鹏因失职未敢及时上报,溥仪得知祖坟被挖后震怒,但无权惩办罪犯,只能将于鹏从宗室除名,并向民国政府通电要求严惩盗墓人犯。
清东陵珍宝流失案引发社会舆论谴责,国内外媒体广泛报道,民间要求追回国宝、严办盗墓罪犯。迫于舆论压力,民国政府下令阎锡山查办此案,溥仪则派出东陵善后处理组赶赴现场。地宫内部千疮百孔,棺椁被毁,尸骨散落,慈禧陵墓惨状尤为触目惊心。
善后处理组对陵墓地宫破坏进行清理,勉强修复棺椁,将乾隆帝与后妃尸骨合葬,并重新收敛慈禧遗体。由于局势限制,无法大修陵墓,仅封闭地宫以防再次盗掘。清东陵盗宝案暴露了民国政府对皇室遗产保护的失责,皇室尊严与陵寝庄严荡然无存,成为历史上一大耻辱。